中国科学院昆明植物研究所位于素有"春城"之称的昆明市北市区黑龙潭风景区，创建于1938年。研究所设有植物化学与西部植物资源持续利用国家重点实验室、中国科学院东亚植物多样性与生物地理学重点实验室、国家重大科学工程"中国西南野生生物种质资源库"、资源植物与生物技术所级重点实验室和昆明植物园，经过70余年的发展与积累，研究所已成为国际上在植物多样性、植物资源研究和生物技术产业领域具有重大影响的研究机构。
昆明植物研究所拥有公共技术服务中心、科技信息中心和丽江生态系统定位研究站等科研支撑体系，其中公共技术服务中心拥有众多高档的大型仪器设备，如800兆、600兆、500兆和400兆超导核磁共振仪、高分辨质谱仪、X射线晶体衍射仪、电子扫描显微镜、SOLEX基因组分析系统、生物芯片扫描仪、激光共聚焦显微镜等。标本馆收藏植物标本137万余份，种质资源库保藏种质资源62000余份，图书馆藏书27万册。近年来我所在基础研究与应用研究方面取得了多项重大成果，获得国家、省部委多项奖励，其中我所植物学家吴征鎰院士等主持撰写的《中国植物志》摘得2009年度国家科技奖自然科学一等奖的桂冠；吴征镒院士获得2007年国家最高科学技术奖；周俊院士、孙汉董院士分别获2006、2008年度云南省科学技术突出贡献奖。
研究所目前在职的科研和管理人员有540人，其中中国科学院院士2人，国家"外专千人计划"1人，国家杰出青年科学基金获得者10人，"青年千人计划"入选者4人，优秀青年科学基金获得者2人，中科院"百人计划"入选者25人，副高及以上研究人员200余人。现有博士生导师42人，硕士生导师69人。研究所现有生物学和药学两个一级学科点，下设有植物学、生物化学与分子生物学、药物化学以及药理学4个博士学位点；现有植物学、生物化学与分子生物学、药物化学、药理学4个学术型硕士学位点以及生物工程和药学2个专业型硕士学位点。现有在读研究生459人，其中博士留学生27人，分别来自美国、法国、尼泊尔、巴基斯坦和泰国等国家。另有在所联合培养研究生及客座生100余人。
2017年预计共招收硕士生60人，其中推荐免试生约20人。
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